PubMed MCP сервер

PubMed MCP сервер обеспечивает мост между AI-ассистентами и огромным репозиторием биомедицинской литературы PubMed, позволяя AI-моделям искать научные статьи, получать доступ к их метаданным и выполнять глубокий анализ программно.

Установка

Smithery - Claude

npx -y @smithery/cli install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client claude

Smithery - Cursor

npx -y @smithery/cli@latest run @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cursor --config "{}"

Smithery - Windsurf

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client windsurf --config "{}"

Smithery - CLine

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cline --config "{}"

Из исходников

git clone https://github.com/JackKuo666/PubMed-MCP-Server.git
cd PubMed-MCP-Server
pip install -r requirements.txt

Конфигурация

Claude Desktop (Mac OS)

{
  "mcpServers": {
    "pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "pubmed-mcp-server"]
      }
  }
}

Claude Desktop (Windows)

{
  "mcpServers": {
    "pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR\\PATH\\miniconda3\\envs\\mcp_server\\python.exe",
      "args": [
        "D:\\code\\YOUR\\PATH\\PubMed-MCP-Server\\pubmed_server.py"
      ],
      "env": {},
      "disabled": false,
      "autoApprove": []
    }
  }
}

Cline

{
  "mcpServers": {
    "pubmed": {
      "command": "bash",
      "args": [
        "-c",
        "source /home/YOUR/PATH/mcp-server-pubmed/.venv/bin/activate && python /home/YOUR/PATH/pubmed-mcp-server.py"
      ],
      "env": {},
      "disabled": false,
      "autoApprove": []
    }
  }
}

Доступные инструменты

Инструмент	Описание
`search_pubmed_key_words`	Поиск статей в PubMed по ключевым словам
`search_pubmed_advanced`	Расширенный поиск статей в PubMed с несколькими параметрами
`get_pubmed_article_metadata`	Получение метаданных статьи PubMed по её PMID
`download_pubmed_pdf`	Попытка скачивания полнотекстового PDF для статьи PubMed
`deep_paper_analysis`	Всестороннний анализ статьи PubMed

Возможности

Поиск статей: Запросы к статьям PubMed по ключевым словам или расширенному поиску
Эффективное получение данных: Быстрый доступ к метаданным статей
Доступ к метаданным: Получение подробных метаданных для конкретных статей
Поддержка исследований: Помощь в исследованиях и анализе в области биомедицинских наук
Доступ к статьям: Попытка скачивания полнотекстового PDF-контента
Глубокий анализ: Всесторонний анализ статей
Исследовательские промпты: Набор специализированных промптов для анализа статей

Примеры использования

Можешь найти в PubMed свежие статьи про CRISPR?

Покажи мне метаданные статьи с PMID 12345678?

Выполни глубокий анализ статьи с PMID 12345678?

Ресурсы

GitHub Repository

Примечания

Этот инструмент предназначен только для исследовательских целей. Пожалуйста, соблюдайте условия использования PubMed и используйте этот инструмент ответственно. Требует Python 3.10+ и библиотеку FastMCP.